【迁移】药理一:传出神经系统药物之胆碱受体 传出神经分植物神经和运动神经,前者支配心肌、平滑肌和腺体等,后者支配骨骼肌。植物神经分交感和副交感(副交感节前纤维常在迷走神经内走行),交感兴奋时效应器表现为应急时的状态,副交感兴奋时效应器表现为睡眠时的状态。 ACh、AChE相关药 拟胆碱药分两类,兴奋受体抑制酶 匹罗卡品作用眼,外用治疗青光眼 阿托交替芸香碱,防止虹膜晶状粘 贝胆碱、腹气胀,兴奋泌尿和胃肠 新斯地明抗酯酶,主治重症肌无力 术 2022-10-07 #药理
【迁移】药理二:传出神经系统药物之肾上腺受体 激动药 药物种类 麻黄碱、多巴胺,α β 肾上腺 去甲肾、间羟胺,β 只有异丙肾 肾上腺素 α β 受体兴奋药,肾上腺素是代表 血管收缩血压升,局麻用它延时间 局部止血效明显,过敏休克当首选 心脏兴奋气管扩,哮喘持续它能缓 心跳骤停用三联,应用注意心血管 α 受体被阻断,升压作用能翻转 心衰高压脑硬化,甲亢糖尿都禁用 多巴胺 α β 多巴胺,心脏兴奋血压升 肾脏调节分两种,中低多巴血流增 高浓α 2022-10-07 #药理
【迁移】19级临八药理第一次小测 拟胆碱药物是(A) A Physostigmine B Anisodamine C Solifenacin D Scopolamine E Atropine 主要发挥中枢抗胆碱作用的药物是(A) A 东莨菪碱 B 毒扁豆碱 C 山莨菪碱 D 阿托品 E 毛果芸香碱 去甲肾上腺素治疗消化道出血时的给药途径为(A) A 口服 B 肌内注射 C 舌下给药 D 皮下注射 E 静脉滴注 A 2022-10-07 #药理
【迁移】导出SingleR需要的数据 loom文件使用记录 随着单细胞数据量的增长,计算要求成指数增长,当数据量大于10万个细胞的时候,seurat包分析就显得非常有压力了,因为在实时内存中储存数据就变得非常困难,HDF5数据格式提供了高效的磁盘存储,而不是在内存中存储数据,这就将分析扩展到大规模数据集,甚至可以达到大于100万细胞的级别 ,Linnarson实验室开发了一种基于hdf5的数据结构,loom,可以方便地存储单细胞基因组 2022-10-04 #SingleR
【迁移】给VMware虚拟机加硬盘 买了一台零刻 SER5 Pro 32G作为虚拟机的宿主机,用了一个月感觉还行,准备加装一个铠侠TC10 1T SATA3固态。小心排线接口上有个黑色的东东,先用镊子挑起来再拔。然后虚拟机设置里添加磁盘。 挂载磁盘并设置开机自动mount sudo su fdisk -l #i查看可挂载磁盘 mkfs.ext4 /dev/sdb #格式化为ext4 # apt install util-linux 2022-10-02 #VMware
【迁移】基于NMF分解的降维聚类 安装补充包 conda activate seurat conda install -c conda-forge r-nmf -y conda install -c conda-forge r-fastica -y 获取非负表达矩阵 使用《使用metacell进行分群聚类》中的数据 1234567891011121314151617sce <- readRDS('SRX8890 2022-10-02 #nmf
【迁移】使用metacell进行分群聚类 预处理 12345678910111213141516171819202122232425262728293031f_QC_plot <- function(sce){ options(repr.plot.width = 12, repr.plot.height = 6) print(Seurat::VlnPlot(sce, features = c("nFe 2022-10-01 #metacell
【迁移】使用FindTransferAnchors对样本进行预注释 处理参考样本 12345678910111213ref_sce <- readRDS('~/upload/zl_liu/data/pca.rds')ref_sce <- subset(ref_sce, group == 'CRPC')table(ref_sce@meta.data$cell_type_fig3)g2m_genes <- Se 2022-09-29 #FindTransferAnchors
【迁移】使用SCTransform标准化 安装包 conda create -n seurat -c conda-forge r-seurat=4.1.1 -y conda activate seurat conda install -c conda-forge r-tidyverse -y conda install -c conda-forge r-irkernel -y Rscript -e “IRkernel::installs 2022-09-29 #SCTransform
【迁移】使用Bootstrap法计算自举置信区间 计算药物LD50用Bliss法最严谨,而改良寇氏法计算的结果误差也不大,因此做了一次改良寇氏法计算LD50的实验。最后需要计算一下结果的可信区间,于是来试试万能的Bootstrap法 安装包(这个例子用不上) conda activate MICE conda install -c conda-forge r-boot=1.3_28 -y 构造样本 组别 剂量 mg/kg 动物数 死亡数 2022-09-27 #Bootstrap